Je viens de faire un test (en suivant la procédure du guide) et effectivement il y a des champs rouges la afin de la fusion mais c'est normal.
Cependant, cela ne signifie pas que ça ne fonctionne pas.
Dans l’exemple ci-dessous c'est le document (maitre) que word affiche mais lors mon édition en PDF tout a bien fonctionné.
Le document maitre sur word
et voilà le document fusionné :
Bonne continuation.